合作备忘录明确联合惩戒对象为：食品药品监督管理部门公布的存在严重失信行为的食品（含食品添加剂）、药品、化妆品、医疗器械（以下简称食品药品）生产经营者。该生产经营者为企业的，联合惩戒对象为企业及其法定代表人、负有直接责任的有关人员；该生产经营者为其他经济组织的，联合惩戒对象为其他经济组织及其负责人；该生产经营者为自然人的，联合惩戒对象为本人。
依据相关法律法规，食品药品监督管理部门采取的惩戒措施依据食品药品生产经营严重失信者失信情节的严重程度，可以为一项或者多项措施：一是列为重点监管对象，加密日常监督检查频次，提升企业风险管理等级；至少每半年对企业进货查验、索证索票、出厂检验、企业自查等管理制度和执行情况进行一次全面、深入的监督检查；二是在一定期限内限制从事食品药品生产经营活动；三是责令企业定期开展食品药品安全自查或者邀请第三方进行检查评价；四是对严重失信者违反相关法律法规的，从严从重处罚。
跨部门的联合惩戒措施体现在：申请政府性资金支持、申请发行企业债券、申请粮食和食糖进口关税配额、参与政府采购活动；取得政府供应土地、申请信贷融资或办理信用卡、股票发行审核、申请办理通关业务、申请国境口岸卫生许可、税收管理、新的科技扶持项目、新网站开办等方面，或从严审核，或不予支持，或加以限制，或取消参加评先评优资格，或列入重点监控对象。合作备忘录明确，对刊播违法广告的刊播者要依法加强管理。
