处方药未解禁
行业发展的最大障碍是政策壁垒。医保放开和处方药网售解禁尤为重要。医疗机构是处方药的主要销售机构，在国内药品终端销售收入中，超过80%的药物为处方药，因为新农合、医保等医疗保障体系与网上药店不能对接，医保卡在网上药店购买药物时不能使用，也限制了零售药店(包括网上药店)的销售增长。
缺乏医保的支撑
目前的互联网医疗行业，缺乏行业标准、无保证信息真实可靠的机制以及认定行为责任的机制，被称为互联网医疗发展的最终限制。当务之急是研究制定与之相关的法律法规，明确互联网医疗信息甄别监管机制、互联网医疗适用范围和诊疗规范，以保证互联网医疗进入医保后，保险公司与医保部门有能力进行费用管控。此外，如互联网医疗与传统医疗机构能够合理对接，建立医疗领域里的O2O模式，便可以在确保医疗质量的情况下，发挥互联网医疗节约成本、方便快捷的优势。
思维模式落后是当前移动互联网医院发展的最大障碍，由于缺乏对移动互联网大趋势的认识，部分医疗卫生主管部门、医院领导不愿意主动接受变革。此外，能否开放移动医保实时结算，直接影响支付时使用移动服务平台的医保患者数量。
远程医疗的制约
国家卫计委发布的《关于推进医疗机构远程医疗服务的意见》规定“非医疗机构不得开展远程医疗服务”和“医务人员向本医疗机构外的患者直接提供远程医疗服务的，应当经其执业注册的医疗机构同意，并使用医疗机构统一的信息平台”。这在一定程度上限制了互联网医疗的发展。
