有研究慈善税收法律制度的人士表示，《慈善法》没有出台前，对于企业公益性捐赠支出，超过年度利润总额12%的部分，不准当年在计算应纳税所得额时扣除，也没有规定结转以后，几个年度可以扣除。
从2016年9月1日起实施的《慈善法》规定：自然人、法人和其他组织捐赠财产用于慈善活动的，依法享受税收优惠。企业慈善捐赠支出超过法律规定的准予在计算企业所得税应纳税所得额时当年扣除的部分，允许结转以后三年内计算应纳税所得额时扣除。
据介绍，这是《慈善法》对现行税收政策的重大突破，也是一大亮点，是对现实问题的回应，现实中有些企业一次性捐赠数额比较大，可能超出了当年利润总额的12%;如果不能结转，当年捐赠额超出扣除限额的部分就无法享受税收优惠，十分不利于大额捐赠。《慈善法》对结转问题有了新的调整，对于希望进行一次性大额捐赠的企业捐赠者，是利好消息。
肖捷表示，按照十八届三中全会决定关于“税收优惠政策统一由专门税收法律法规规定”的要求，为进一步落实税收法定原则，与《慈善法》中有关公益性捐赠支出结转扣除的规定做好衔接，建议修改企业所得税法第九条。
草案将现行企业所得税法第九条修改为：企业发生的公益性捐赠支出，在年度利润总额12%以内的部分，准予在计算应纳税所得额时扣除;超过年度利润总额12%的部分，准予结转以后三年内在计算应纳税所得额时扣除
