截至2019年1月底，全国跨省异地就医定点医疗机构数量为15933家，二级及以下定点医疗机构13302家。国家平台备案人数356万。自2017年1月启动以来，累计实现跨省异地就医直接结算170万人次，医疗费用409.5亿元，基金支付240.7亿元，基金支付比例58.8%。基金支付超过1万元为64.7万人次,超过5万元为8.4万人次，超过10万元为1.4万人次。
2019年1月，跨省异地就医定点医疗机构数量新增522家;基层医疗机构覆盖范围持续扩大，二级及以下定点医疗机构新增499家。1月单月跨省异地就医直接结算17.4万人次，比上月增长3.0%;医疗费用41.5亿元，基金支付24.2亿元，基金支付比例58.3%。日均直接结算5613人次。职工及城乡居民医保单日结算峰值首次突破9000人次，并于1月28日达到9025人次，当日发生医疗费用2.3亿元，基金支付1.3亿元。
根据国家医保局公布的名单显示，北京有660家定点医疗机构已与国家异地就医结算系统对接，既包括中日友好医院、中国医学科学院北京协和医院等100家三级医院，也有朝阳区高碑店社区卫生服务中心、平谷区大华山镇社区卫生服务中心等社区、乡镇医疗机构。
